Panorama general de las variantes en el número de copias en la población española con demencia.
Antecedentes.
Estudios recientes sugieren que las variantes del número de copias (CNV) podrían contribuir a la heredabilidad no observada de enfermedades complejas como la enfermedad de Alzheimer (EA) y las demencias relacionadas con la EA (ADRD).
Métodos.
Se realizó un análisis de CNV utilizando datos de genotipado (matriz Axiom 815K del biobanco español) procedentes del conjunto de datos sobre demencia GR@ACE/DEGESCO (n = 20.067) de la población española. Mediante la aplicación de PennCNV y un exhaustivo control de calidad, se seleccionaron 8.275 controles y 7.818 casos de demencia para el análisis de asociaciones a nivel génico entre casos y controles.
Resultados.
Identificamos 43.833 CNV con deleciones (47 %) y duplicaciones (53 %). No se encontraron asociaciones significativas a nivel genómico, pero se observaron asociaciones nominales en los loci PKP3-SIGIRR y FBRSL1. Las CNV en 2.970 genes eran exclusivas de los casos de demencia, enriquecidas en vías relacionadas con el sistema vascular. Entre los hallazgos destacados se incluyen la duplicación 14q11.2 y las deleciones de VPS13B en casos de ADRD, estas últimas confirmadas mediante mapeo genómico óptico.
Conclusión.
Los hallazgos sugieren posibles genes nuevos asociados a la ADRD en la población española. Sin embargo, la resolución limitada de las tecnologías basadas en microarrays para detectar CNV justifica una investigación más profunda.
Más información:
https://www.medrxiv.org/content/10.64898/2026.01.26.26344703v1